Strategické vedenie inštitúcie určuje na základe stanov a uznesení Valného zhromaždenia Rada Konfuciovho inštitútu.
Zloženie rady Konfuciovho inštitútu pri UK:
PREDSEDA: prof. Mgr. Marián Zouhar, PhD., dekan Filozofickej fakulty UK v BA
ČÍNSKY PREDSEDA: prof. Wang Mingyi, prezident Sichuan Normal University
ČLENOVIA RADY:
Univerzita Komenského v Bratislave:
Mgr. Daniela Zhang Cziráková, PhD., sinologička;
Mgr. Ľuboš Gajdoš, PhD., sinológ;
prof. Mgr. Janka Benická, PhD., sinologička
Sichuan Normal University:
Prof. YE Rong, PhD., zástupkyňa riaditeľky Kancelárie Konfuciových inštitútov;